Таблица 3-8. Характеристики пероксисомных болезней
|
Дефицит или биохимический дефект фермента
|
Повышено содержание ЖКОДЦ
|
Нарушение синтеза плазмалогена
|
Нарушение синтеза желчных кислот
|
Нарушение окисления фитановой кислоты
|
Повышенное содержание пипеко-линовой
|
Другие
|
Группа I: Генерализованные пероксисомные нарушения вследствие нарушения биосинтеза пероксисом
|
Синдром Цельвегера
|
Множественные
|
+
|
+
|
+
|
+/-
|
+
|
-
|
Неонатальная АЛД
|
Множественные
|
+
|
+
|
+
|
+/-
|
+
|
-
|
Детская болезнь Рефсума
|
Множественные
|
+
|
+
|
+
|
+
|
+
|
-
|
Гиперпипеколовая ацидемия
|
Множественные
|
+
|
+
|
+
|
+/-
|
+
|
-
|
Группа II: Дефект более одного пероксисомного фермента, интактные пероксисомы
|
Цельвегероподобный синдром
|
Множественные
|
+
|
+
|
+
|
|
-
|
-
|
Ризомелическая точечная хондродисплазия
|
Ацил-СоА: DHAPAT, а-окисление фитановой кислоты
|
-
|
+
|
-
|
+
|
-
|
-
|
Группа III: Дефект одного пероксисомного фермента, интактные пероксисомы
|
АЛД/АМН
|
Лигноцерил-СоА-лигаза
|
+
|
-
|
|
|
-
|
-
|
Псевдонеонатальная АЛД
|
Ацил-СоА-оксидаза
|
+
|
-
|
|
-
|
-
|
-
|
Недостаток бифункционального фермента
|
Бифункциональ-ный фермент
|
+
|
-
|
+
|
-
|
-
|
-
|
Синдром псевдо-Цельвегера
|
3-оксоацил-СоА-тиолаза
|
+
|
-
|
+
|
|
-
|
+/-
|
Гипероксалурия I типа
|
Аланин: глиоксилатамино-трансфераза
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
+
|
Акаталаземия
|
Каталаза
|
-
|
|
-
|
|
--
|
+
|
Недостаток глутарил-СоА-оксидазы
|
Глутарил-СоА-оксидаза
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
+
|
Воспроизведено с разрешения из Seashore MR, Wappner RS: Genetics in Primary Care & Clinical Medicine, Appleton &Lange, 1996, p. 218.
АЛД – адренолейкодистрофия; АМН – адреномиелонейропатия; СоА – кофермент A; DHAPAT – дигидрокси-ацетонфосфатацилтрансфераза; ЖКОДЦ – жирные кислоты с очень длинными боковыми цепями; + – нарушения; – норма.
Основные пероксисомные болезни человека
Некоторые наследственные заболевания связаны с нарушением функции пероксисом. Например, синдром Цельвегера (СЦ) обусловлен почти полной потерей пероксисомной функции и классифицируется как заболевание I группы, наиболее тяжелой в этом типе наследственных патологий. При синдроме Цельвегера в пероксисоме отсутствует большое число важных ферментов. Пациенты с заболеваниями I группы умирают в детском возрасте. Ко II группе относятся менее тяжелые пероксисомные заболевания, например цельвегероподобные синдромы, для которых характерно большее содержание пероксисомных ферментов. Заболевания III группы, например адренолейкодистрофия, характеризуются нарушением функционирования одного пероксисомного фермента. Это наименее тяжелая форма пероксисомных заболеваний.
Митохондрии
Митохондрии – органеллы синтеза АТФ. Их основная функция связана с окислением органических соединений и использованием освобождающейся при распаде этих соединений энергии для синтеза молекул АТФ. Исходя из этого, митохондрии часто называют энергетическими станциями клетки, или органеллами клеточного дыхания.
Термин “митохондрия” был введен Бенда в 1897 г. для обозначения зернистых и нитчатых структур в цитоплазме разных клеток. Митохондрии можно наблюдать в живых клетках, так как они обладают достаточно высокой плотностью. В живых клетках митохондрии могут перемещаться, сливаться друг с другом, делиться.
Форма и размеры митохондрий животных клеток разнообразны, но в среднем толщина их около 0,5 мкм, а длина – от 1 до 10 мкм. Подсчеты показывают, что количество их в клетках сильно варьирует – от единичных элементов до сотен. Так, в клетке печени они составляют более 20% общего объема цитоплазмы и содержат около 30-35% общего количества белка в клетке. Площадь поверхности всех митохондрий печеночной клетки в 4-5 раз больше поверхности ее плазматической мембраны.
Обычно митохондрии скапливаются вблизи тех участков цитоплазмы, где возникает потребность в АТФ. Так, в сердечной мышце митохондрии находятся вблизи миофибрилл. В сперматозоидах митохондрии образуют спиральный футляр вокруг оси жгутика и т.д. Митохондрии в клетках могут увеличиваться в размерах и числе. В последнем случае происходит деление перетяжкой или фрагментация (почкование) исходных крупных митохондрий на более мелкие, которые в свою очередь могут расти и снова делиться.
Митохондриальные мембраны
Митохондрии ограничены двумя мембранами толщиной около 7 нм. Наружная митохондриальная мембрана отделяет их от гиалоплазмы. Обычно она имеет ровные контуры и замкнута, так что представляет собой мембранный мешок. Внешнюю мембрану от внутренней отделяет межмембранное пространство шириной около 10-20 нм. Наружная мембрана содержит значительное количество белка, порина. Этот белок формирует поры с диаметром, позволяющим молекулам размером до 5000 дальтон свободно проходить в первую полость. Таким образом, ионы, аминокислоты, сахара и другие цитозольные компоненты беспрепятственно проходят в первое, межмембранное пространство. Группа ферментов, локализованная в этом пространстве, фосфорилирует иуклеотиды и сахара нуклеотидов.
Внутренняя митохондриальная мембрана ограничивает собственно внутреннее содержимое митохондрии, ее матрикс. Она формирует гораздо более плотный барьер, она значительно больше наружной мембраны и образует множество смежных складок – крист. Эти складки значительно увеличивают площадь поверхности митохондрий. Многие ферментативные реакции происходят более эффективно, если ферменты связаны с митохондриальной поверхностью, что и обеспечивают кристы (см. рис. 5-1).
В мембранах крист митохондрии располагаются системы дальнейшего переноса электронов и сопряженного с ним фосфорилирования АДФ (окислительное фосфорилирование). При этом происходит перенос электронов от одного белка-акцептора электронов к другому и, наконец, связывание их с кислородом, вследствие чего образуется вода. Одновременно с этим часть энергии, выделяемой при таком окислении в цепи переноса электронов, запасается в виде макроэргической связи при фосфорилировании АДФ, что приводит к образованию большого числа молекул АТФ – основного внутриклеточного энергетического эквивалента. Именно на мембранах крист митохондрии происходит процесс окислительного фосфорилирования с помощью здесь расположенных белков цепи окисления и ферментов фосфорилирования АДФ, АТФ-синтетазы.
Митохондриальный матрикс
Матрикс митохондрий имеет тонкозернистое строение в нем иногда выявляются тонкие нити (толщиной около 2-3 нм) и гранулы размером около 15-20 нм. Нити матрикса митохондрий представляют собой молекулы ДНК, а мелкие гранулы – митохондриальные рибосомы.
Основной функцией митохондрий является синтез АТФ, происходящий в результате процессов окисления органических субстратов и фосфорилирования АДФ. Начальные этапы этих сложных процессов совершаются в гиалоплазме. Здесь происходит первичное окисление субстратов (например, сахаров) до пировиноградной кислоты (пирувата) с одновременным синтезом небольшого количества АТФ. Эти процессы совершаются в отсутствие кислорода (анаэробное окисление, гликолиз). Все последующие этапы выработки энергии (дыхания) – аэробное окисление и синтез основной массы АТФ – осуществляются с потреблением кислорода и локализуются внутри митохондрий. При этом происходит дальнейшее окисление пирувата и других субстратов энергетического обмена с выделением СО2 и переносом протонов на их акцепторы. Эти реакции осуществляются с помощью ряда ферментов так называемого цикла трикарбоновых кислот, которые локализованы в матриксе митохондрии.
Митохондриальная ДНК
Выявлено, что в матриксе митохондрии локализуется автономная система митохондриального белкового синтеза. Она представлена молекулами ДНК, свободными от гистонов, что сближает их с ДНК бактериальных клеток. На этих ДНК происходит синтез молекул РНК разных типов: информационных, трансферных (транспортных) и рибосомных. В матриксе митохондрий наблюдается образование рибосом, отличных от рибосом цитоплазмы. Эти рибосомы участвуют в синтезе ряда митохондриальных белков, не кодируемых ядром. Однако такая система белкового синтеза не обеспечивает всех функций митохондрий, поэтому автономию митохондрий можно считать ограниченной, относительной. Малые размеры молекул митохондриальных ДНК не могут определить синтез всех белков митохондрий. Показано, что большинство белков митохондрий находится под генетическим контролем со стороны клеточного ядра и синтезируется в цитоплазме. Наиболее вероятно, что митохондриальная ДНК кодирует лишь немногие митохондриальные белки, которые локализованы в мембранах и представляют собой структурные белки, ответственные за правильную интеграцию в митохондриальных мембранах отдельных функциональных белковых комплексов.
Свойства митохондриальной ДНК:
-
небольшая и содержит около 16,5 кб, то есть приблизительно в 105 раз меньше, чем ДНК, локализованная в ядре;
-
кольцевая и кодирует 2 рибосомные РНК, 22 транспортных РНК (тРНК) и 13 белков.
Генетический код митохондрий, определяющий отдельные аминокислоты, немного отличается от кода ядерной ДНК. Митохоидриальный код, например, обладает измененными стоп-кодонами.
Эта органелла обладает функционирующими рибосомами, которые синтезируют белки, используемые в органелле и кодируемые митохондриальной ДНК. Количество транслируемого с митохондриальной мРНК белка ограничено и формирует субъединицы более крупных ферментных комплексов. Митохондрии могут принимать различную форму. Обычно митохондрия делится, по крайней мере, один раз в течение клеточного цикла после репликации ее ДНК, которая происходит во время интерфазы. Эта репликация не связана с S-фазой клетки. Деление митохондрии происходит посредством перетяжки на две, которая начинается с образования кольцевой бороздки на внутренней митохондриальной мембране.
Общая структура и функции митохондрий
Убрать?? Митохондрии – это окруженные двойной мембраной органеллы, которые выполняют функцию метаболического центра клетки. Митохондрии являются местом синтеза аденозинтрифосфата (АТФ). Этот процесс требует участия многих ферментов, большинство из которых поступает из цитозоля (рис. 3-8).
Процесс импорта ферментов очень сложен и включает несколько этапов, описанных ниже. Предполагается, что митохондрии – результат эволюции организмов, которые внедрились в примитивную прокариотическую клетку и сформировали симбиотические отношения с хозяином. Основные признаки митохондрий перечислены в таблице 3-3.
Таблица 3-3. Основные принципы устройства и работы митохондрий
Признаки
|
Значение
|
Происхождение
|
Считается, что митохондрии произошли в результате эволюции от организмов, которые внедрились в примитивную прокариотическую клетку и стали симбиотами с ней
|
Форма
|
Эти органеллы могут принимать различные морфологические формы. Некоторые из них имеют сферическую форму, другие лентовидную
|
Митохондриальная ДНК
|
Митохондриальная ДНК реплицируется в интерфазе, и этот процесс не синхронизирован с репликацией ДНК в ядре. Митохондриальная ДНК отличается от ядерной ДНК и кодирует особые митохондриальные гены
|
Синтез белка
|
Количество транслируемых с митохондриальной мРНК белков ограничено; они формируют субъединицы крупных ферментных комплексов. Митохондрии имеют функционирующие рибосомы, переводящие информацию митохондриальной ДНК в белки, используемые в органелле
|
Клеточное деление
|
Во время клеточного цикла митохондрии один раз делятся надвое, образуя при этом перетяжку. Перетяжка деления развивается, начиная с внутренней митохондриальной мембраны
|
Механизм транспорта митохондриальных белков
Митохондрии служат метаболическим центром клетки; эти органеллы – место синтеза АТФ, процесса, требующего участия многочисленных ферментов, большинство из которых поступает из цитозоля (рис. 3-8). Почти все белки, предназначенные для транспорта в митохондрии, синтезируются па полирибосомах, локализованных в цитозоле.
Белки, предназначенные для транспорта в митохондрии, имеют сигнальный пептид, локализованный на N-конце. Сигнальные пептиды варьируют в размере от 12 до 80 остатков. Этот участок белка также формирует амфифильный завиток: заряженные остатки сгруппированы на одной стороне альфа-спирали, а неполярпые остатки локализованы па другой стороне. Амфифильиый завиток соединяется с участком связывания митохондриального распознающего рецептора, локализованного на наружной мембране.
Процесс транспорта достаточно сложен и включает несколько элементов (табл. 3-4).
Таблица 3-4. Основные элементы системы транспорта белка в митохондрию
Элементы
|
Роль
|
Рибосомы
|
Почти все импортируемые белки производятся на полирибосомах в цитозоле
|
Сигнальный пептид
|
Белки, предназначенные для митохондрий, имеют сигнальные пептиды, локализованные на N-конце
|
Амфифильный завиток
|
Сигнальные пептиды формируют амфифильный завиток. Заряженные остатки сгруппированы на одной стороне завитка, а неполярные остатки локализованы на другой стороне
|
Митохондриальный распознающий рецептор
|
Амфифильный завиток взаимодействует со связывающим доменом митохондриального рецептора распознавания, локализованного на наружной мембране
|
Шапероны
|
Вновь синтезированные для митохондрий белковые цепи связаны с шаперонными белками, которые способствуют определению правильной укладки и функционирования импортированных белков
|
Митохондриальные шапероны
Вновь синтезированные белки, предназначенные для митохондрий, при подготовке к импорту связываются с другим классом цитозольиых белков. Существует несколько типов этих белков, называемых шаперонами. Они обнаруживаются почти во всех клеточных органеллах и в цитоплазме. Кроме других функций, шапероны обеспечивают правильное сворачивание (фолдинг) и окончательную конформацию других белков, и поэтому необходимы для здоровья клетки и организма.
Шапероны найдены во всех организмах – от бактерий до млекопитающих. В некоторых случаях эти белки имеют другое название. Одно из семейств шаперонов называется белками теплового шока (hsp) (рис. 3-9). Их обнаружили случайно: исследователи открыли, что определенные белки синтезируются в клетках плодовой мушки при увеличении температуры всего па несколько градусов. Белки теплового шока имеют большую внутривидовую устойчивость и интенсивно экспрессируются во всех клетках даже в нормальных для роста условиях. Их транскрипция и трансляция значительно возрастают при чрезвычайных условиях внешней среды. Предполагают, что шапероны необходимы для правильного сворачивания белков в условиях теплового стресса.
Укладка полипептидной цепи: шапероны hsp60 и hsp70
Белки семейств hsp60 (также известного как GroEL) и hsp70 (или DnaK) участвуют в сворачивании, переносе и формировании более высокой структурной организации белка.
Во внутреннем митохондриальном пространстве hsp60 и hsp70 связываются с развернутым белком и помогают формированию точной конформационной организации. Этот этап укладки является энергозависимым и требует расщепления АТФ.
Наконец, семейство шаперонов hsp90 принимает участие в регуляции активности некоторых факторов транскрипции и различных белковых киназ. При относительно низкой концентрации белка он легко сворачивается должным образом из-за малой вероятности взаимодействия реактивных групп белка с активными группами других белков. Однако при большой концентрации белка вероятность того, что он сложится должным образом, значительно снижается. Обычно концентрация белка в органеллах эукариотических клеток высока.
Работа шаперонов
Как утверждалось ранее, шапероны находятся почти во всех органеллах и в цитоплазме. Белки-шапероны действуют в основном путем связывания с активной поверхностью полипептидов, например, с гидрофильной поверхностью. Таким образом, шапероны блокируют эти активные поверхности и эффективно предотвращают агрегацию, облегчая правильную укладку полипептидной цепи.
Шапероны не связываются со своим полипептидным субстратом ковалентно. Часто белки должны быть импортированы в несложенном виде и затем вновь уложены после своего прохождения через мембрану органеллы, что также осуществляется частично благодаря шаперонам.
Например, белки теплового шока связываются с растущим полипептидом как только он освобождается от рибосомы. Эти шапероны удерживают рождающуюся молекулу в конформации, предотвращающей преждевременную случайную укладку и способствующей переносу полипептида в митохондриальное пространство. Транспорт белков в митохондрии и высвобождение упакованного белка – АТР-зависимые процессы (табл. 3-5 и 3-6).
Таблица 3-5. Некоторые характеристики шаперонов
Ниже информация из таблицы??
Присутствуют во многих организмах: от бактерий до человека
Многие называются также белками теплового шока (hsp)
Некоторые стимулируются при условиях, вызывающих денатурацию вновь синтезированных белков (например, повышение температуры и различные химические вещества)
Они связываются с развернутым и свернутым белком
Большинство шаперонов обладает АТРазной активностью с вовлечением АТР или ADP во взаимодействие белок – шаперон
Найдены в различных отделах клетки, таких как цитозоль, митохондрия, полость эндоплазматического ретикулума.
Воспроизведено с разрешения авторов из Murray RK et al: Harper's Biochemistry, 24th ed., Appleton & Lange, 1996, p. 497.
Таблица 3-6. Некоторые шапероны и ферменты, участвующие в процессе сворачивания белка в шероховатом эндоплазматическом ретикулуме
• BiP (белок связывания тяжелой цепи иммуноглобулина)
• GRP94 (белок, регулируемый глюкозой)
• Кальнексин
• PDI (дисульфидизомераза)
• PPI (пептидил-пролил-цис-транс-изомераза)______
Воспроизведено с разрешения из Murray RK et al: Harper's Biochemistry, 24th ed., Appleton & Lange, 1996, p. 497.
Достарыңызбен бөлісу: |