Образовательная программа «6D060722- молекулярная и клеточная биология»

УДК 575.1/.2:616-006:612.36 На правах рукописи

ИСАБЕКОВА АСЕЛЬ САНИЯРБЕКОВНА

6D060700- Биология (образовательная программа «6D060722- Молекулярная и клеточная биология»)

Диссертация на соискание ученой степени

доктора философии (PhD)

Научные консультанты:

доктор биологических наук,

профессор Иващенко А.Т.;

Professor, PhD Regnier M.

Республика Казахстан

Алматы, 2012

СОДЕРЖАНИЕ
ОБОЗНАЧЕНИЯ И СОКРАШЕНИЯ		4
ВВЕДЕНИЕ		5
1	ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ	10
1.1	Рак толстой кишки и его генезис	10
1.1.1	Рак толстой кишки социально значимое заболевание	10
1.1.2	Генезис рака толстой кишки	10
1.1.3	Наследственные синдромы	11
1.1.4	Цитогенетика рака толстой кишки (микросателлитные и хромосомные нестабильности)	14
1.1.5	Эпигенетика и рак толстой кишки	15
1.1.6	Модификация гистонов при раке толстой кишки	16
1.1.7	Геномный импринтинг при раке толстой кишки	17
1.1.8	Генетический полиморфизм и риск развития рака толстой кишки	17
1.1.9	Раковые стволовые клетки	19
1.1.10	Стадии рака толстой кишки	21
1.1.11	Ключевые пути развития рака толстой кишки	23
1.1.12	Методы диагностики рака толстой кишки	26
1.2	МикроРНК и их роль при раке толстой кишки	28
1.2.1	Обнаружение микроРНК	28
1.2.2	Общая информация о микроРНК	29
1.2.3	Биогенез микроРНК	29
1.2.4	Регуляция экспрессии с помощью микроРНК	33
1.2.5	Предсказывание генов мишеней микроРНК	34
1.2.6	Г:У пары и неспаренные нуклеотиды в сайтах взаимодействия микроРНК	38
1.2.7	Методы верификации сайтов связывания микроРНК	39
1.2.8	Роль микроРНК в онкогенезе	40
2	МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ	45
2.1	Объекты исследования	45
2.2	Классификации генов	45
2.3	Поиск сайтов взаимодействия микроРНК с мРНК и описания их характеристик	45
2.4	Методика изучения различий между сайтами, предсказанными с помощью программ RNAhybrid и TargetScan	47
2.5	Методика изучения различий между сайтами, предсказанными с помощью программ RNAhybrid и miRanda	48
2.6	Изучение филогенетической консервативности сайтов предсказанных RNAhybrid	48
3	РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ	50
3.1	Характеристики генов ассоциированных с развитием РТК	50
3.2	Характеристики межгенных микроРНК	55
3.3	Взаимодействие межгенных микроРНК с мРНК генов, участвующих в онкогенезе	60
3.4	Характеристика взаимодействия микроРНК с генами мишенями	68
3.5	Изучение различий между сайтами, предсказанных с помощью программ RNAhybrid и TargetScan	71
3.6	Изучение различий между сайтами, предсказанных с помощью программ RNAhybrid и miRanda	76
3.7	Изучение филогенетической консервативности сайтов предсказанных RNAhybrid	80
ЗАКЛЮЧЕНИЕ		89
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ		91
ПРИЛОЖЕНИЕ А		115

жүктеу/скачать 2.9 Mb.

Достарыңызбен бөлісу: