Российская академия наук дальневосточное отделение
Программы, реализующие таблицу Менделеева
жүктеу/скачать 310.5 Kb.
|
- Бұл бет үшін навигация:
- 1.3. Программы визуализации
1.2. Программы, реализующие таблицу МенделееваTable [15] – реализация периодической системы на PC, позволяющая получать исчерпывающую информацию об элементах (более 30 типов данных о каждом химическом элементе), и встроенный химический калькулятор, позволяющий уравнивать химические реакции любой степени сложности, решать химические задачи. Программа включает в себя ряд дополнительных возможностей, в том числе поддержку базы данных реакций, построение графиков по свойствам химических элементов, возможность отображения ряда химической активности металлов, представление периодической системы в более чем 20 различных видах. Основные возможности программы:
Atomic PC [12] – периодическая таблица элементов для PC. В дополнение к стандартной информации, предоставляемой подобными продуктами, эта программа содержит обширные сведения относительно большинства изотопов. ChemAP – периодическая таблица с разнообразными дополнительными функциями: переводом единиц измерения, сравнением элементов, калькулятором атомной массы и т.п. Periodic Table – периодическая таблица, предоставляющая информацию об атомах. Панель сообщений позволяет вырезать и скопировать информацию в другой документ. Показывает 110 элементов и 890 изотопов; имеются больше чем 500 радиоизотопов с деревьями распада. Программа имеет режим тестирования. Также может вычислять молекулярную массу, сравнивать свойства соединений, перечислять свойства в сортируемых списках, строить графики и таблицы, печатать данные. Периодическая таблица имеет более 30 параметров данных о каждом элементе, включая распространенность, точки кипения и плавления, электроотрицательность, валентность, отвечающую степени окисления, и т.д. МХ Таблица Менделеева – программа, предоставляющая информацию о химических элементах (кроме лантаноидов и актиноидов) - плотность, температуры кипения и плавления, электроотрицательность, степени окисления, открытие, распространенность в земной коре и др. Period 3D, Версия 1.2 [13] – программа по химии, имеющая вид таблицы Д.И. Менделеева. Содержит исчерпывающую информацию о каждом элементе (кроме лантаноидов и актиноидов), а также различные химические вычисления: вычисление массы и объёма веществ. Поддерживаются скины, которые можно делать самим. 1.3. Программы визуализацииТрехмерная структура молекулы тесно связана с разнообразием химических, физических и биологических свойств. Необходимость в компьютерной генерации трехмерных молекулярных структур была признана в разработке препаратов и в связанных дисциплинах. CORINA [16] – компьютерная программа, которая автоматически генерирует трехмерные атомные координаты, основываясь на составе молекулы. CORINA применим к полному диапазону органической химии. Могут быть обработаны все структуры, которые можно выразить в понятиях валентных связей. Также рассматривается стереохимическая информация, включая атомы, имеющие до шести соседей. Таким образом, можно обрабатывать даже металлические составы. Нет верхних пределов размеру молекулы или размеру колец. CORINA по умолчанию генерирует одну низко энергетическую структуру для каждой входной структуры. Для кольцевых систем, состоящих из не более чем девяти атомов, можно сгенерировать множественные структуры – полезная особенность для формирования гибких 3D баз данных. Входные структуры могут быть обработаны в ряде файловых форматов (например, MDL SDFile и RDFile, SYBYL MOLFILE и MOL2, SMILES или CTX). Можно выбрать различные типы выходного файла (например, MDL SDFile и RDFile, SYBYL MOLFILE и формат MOL2, PDB или CTX). CORINA предлагает много особенностей для влияния на процесс 3D генерации, например, дополнение недостающих или неявно заданных атомов водорода, нейтрализация внешних зарядов, ориентация 3D структур согласно их моментам инерции, передвижение встречных ионов в солях и т.д.
|