В эволюционную биологию Свидетельства эволюции и макроэволюция

1. ОСНОВНЫЕ ПОНЯТИЯ (2 часа)

Эволюция, анагенез, кладогенез, фазовое пространство, детерминизм, пространство генотипов, уровни организации, фенотип, признак, приспособленность, адаптация, мутация, популяция, отбор, аллельное замещение, эволюция по Ламарку и по Дарвину, адаптивный ландшафт, сходство, родство, совместимость, связность, клада, вид, сложность, оптимальность, способность к эволюции, эволюционная достижимость, стохастичность, воспроизводимость, случайный дрейф, микроэволюция, макроэволюция.

2. ЭВОЛЮЦИЯ В ПРОШЛОМ

2.1 Непрямые доказательства эволюции (4 часа)

Неоптимальные фенотипы, гомологии, иерархические распределения признаков, закономерности пространственного распределения видов, доказательства основанные на простых сценариях и теориях.

2.2 Построение филогенетических деревьев (2 часа)

Определение дерева и количество возможных филогенетических деревьев. Дивергенция и гомоплазии. Реконструкция дивергентной эволюции методом максимальной экономии. Реконструкции анцестральных состояний. Реконструкция эволюции, происходившей с постоянной скоростью, методами кластерного анализа. Методы максимального правдоподобия и Байесовские методы. Филогении, которые не являются деревьями. Примеры использования филогенетических реконструкций.

2.3 Закономерности эволюции в прошлом (4 часа)

Закономерности, относящиеся к различным уровням организации. Закономерности, относящиеся к происхождению разнообразия живых организмов. Закономерности, относящиеся к происхождению сложных адаптаций.

2.4 Непосредственные наблюдения за эволюцией (2 часа)

Быстрая эволюция в природе. Одомашнивание. Эволюционные эксперименты над контролируемыми популяциями. Эволюция патогенов и раковых клеток.

3. МАКРОЭВОЛЮЦИЯ

3.1 Макроэволюция геномов (2 часа)

Эволюционные расстояния. Формула Джукса-Кантора. Гомологии сайтов и сегментов последовательностей. Динамика транспозонов. Дегенерация нерекомбинирующих хромосом. Эволюция семейств паралогических генов.

3.2 Макроэволюция сложных фенотипов (2 часа)

Адаптвные ландшафты на больших масштабах. Начала теории эволюции сложных адаптаций. Модели происхождения жизни. Возможные эволюционные механизмы возникновения сложности, модулярности и грубости.

3.3 Макроэволюция простых фенотипов (4 часа)

Модификаторы, генетические конфликты и частотно-зависимые адаптивные ландшафты. Эволюция невозаимодействующих особей: фенотипическая пластичность, неинтерактивное поведение, жизненные стратегии, стадии покоя, размер кладки, старение. Эволюция передачи генетического материала: мутабильность, поддержание полового размножения, кроссинговер, системы скрещивания, происхождение полового размножения. Эволюция взаимодействий между особями: предупреждающая окраска, агрессия, кооперация и альтруизм. Сложные явления: эволюция адаптивных ландшафтов, происхождения многоклеточности и колониальности, анизогамия и распределение ресурсов между полами, выбор партнеров при размножении, коэволюция предпочтений самок и фенотипов самцов, конфликты между гаметами и полами, конфликты родителей и потомков, эусоциальность.

3.4 Макроэволюция экосистем (2 часа)