Материалы и методы исследований. Исследовательская работа проведена в полевых
и лабораторных условиях. Для своевременного выявления бактериального ожога проводились
регулярные обследования насаждений яблони юга и юго-востока Казахстана во время
вегетационного периода по методикам выявления и идентификации возбудителя ожога
плодовых деревьев [16, 17]. Обследования насаждений яблони по выявлению возбудителя
бактериального ожога на сортах яблони проведены в крупных производственных садах и
фермерских хозяйствах Туркестанской, Жамбылской, Алматинской и Жетысуской областей и
коллекционных насаждениях ТОО «КазНИИ плодоовощеводства», расположенный в
Талгарском районе Алматинской области.
С деревьев с явно выраженными симптомами поражения бактериальным ожогом
отбирали ветки, листья для проведения микробиологических исследований. Для
бактериологического анализа, подтверждающего наличие Erwinia amylovora в растении
отбирали свежие образцы из коры, взятой на границе язвы, а также из бактериального
экссудата, и согнутых кончиков молодых побегов.
Выделение чистой культуры возбудителей бактериального ожога проводили по
общепринятым методикам на 3-х питательных средах: картофельном агаре, Левановой среде и
среде Кинга Б [17].
Выделение ДНК из бактериальной культуры. Экстракцию нуклеиновых кислот
проводили с использованием PrepMan™ Ultra Sample Preparation Reagent и методом кипячения.
В 100 мкл деионизированной воды вносили с помощью бактериологической петли колонию
бактерии, далее добавляли 50 мкл реагента PrepMan™ Ultra тщательно вортексировали.
Пробирки помещали в термостат на 10 минут при 99
⁰С. После инкубации содержимое
центрифугировали при 13.4 тыс. об/мин 2 минуты. 50 мкл супернатанта переносили в чистые
пробирки.
При методе выделения кипячением мазки культуры добавляли в 200 мкл
деионизированной воды, затем образцы помещали в водяную баню или термостат при 100
⁰С
на 10 минут. После инкубации содержимое в центрифугировали при 13.4 тыс. об/мин 2 минуты.
50 мкл супернатанта, содержащего ДНК переносили в чистые пробирки.
Постановка ПЦР. Для подтверждения принадлежности выдленных культур к Erwinia
amylovora использовали классический метод ПЦР. ПЦР проводили с использованием
праймеров описанных Taylor et al. [18], Gottsberger [19], Stöger et al. [20]. Реакцию ставили в
|