1857 жылы Шоқанды Қырғыз еліне əр түрлі материал жинауға жібереді. Ал 1858 жылы Қашқарға жөнелтілген экспедициясымен бірге көп тапсырмалар беріп, оны Қашқарға жібереді. 1858 жылы 27 сентябрьде Қашқарға барып, 1859 ж. 11-мартқа дейін сонда болады. Ол жердің жаратылысы, этнографиясы, тарихы, экономикалық жəне саяси тұрмысы жөнінде көп материалдар жинап, өзіне тапсырылған міндеттерді толық орындап қайтады. Сол 5-6 айдың ішінде ұйғыр тілін үйренеді, Шығыс тарихы жайында сирек кездесетін кітаптарды қолға түсiрiп алады.
