Медициналық микробиология келесі түрлерге бөлінеді

A. Вирусология - вирустарды зерттейді.

Б. Протозология - қарапайымдыларды зерттейді.

B. Микология - саңырауқұлақтарды зерттейді.

Г. Иммунология - адам ағзасының қорғаныс қабілетін зерттейді.

2. Санитарлық микробиология - қоршаған ортадағы, ауадағы, судағы микробтардың адамның денсаулығы мен тазалығына тигізетін әсерін зерттейді.

3. Ауылшаруашылық микробиологиясы - топырақты құнарландыру, мал азығын дайындауда микробтардың қасиеттерін пайдалануды зерттейді.

4. Өндірістік микробиология - микробтардың белсенділігі, қасиеттері заводтарда кейбір металдарды қорытқанда, спирт ашыту өнеркәсібінде, витаминдер, антибиотиктер өндірістерінде пайдаланылады. Тамақ өндірісінде - нан ашыту, айран, қымыз ашыту процессінде, кондитер фабрикаларында - мармелад, пастилалар т.б. дайдаланылады.

5. Ветеринарлық микробиология - жануарлардың, малдардың жұқпалы ауруларын, олардың алдын - алу шараларын зерттейді.

6. Ғарыштық микробиология - ғарыштың микробтарға, адам микрофлорасына әсерін зерттейді.