В годы Великой Отечественной войны (1941-45гг) одними и первых в схватку с немецко-фашистскими захватчиками вступили летчики морской авиации Северного и Балтийского флотов.
Морская авиация Балтийского флота принимала участие как в оборонительных, так и в наступательных операциях Красной армии и решала не только традиционные для Морской Авиации задачи. Части бомбардировочной и минно-торпедной авиации наносили удары по танковым и пехотным колоннам противника, наступающим на Ленинград, а истребители и летающие лодки неоднократно привлекались к штурмовым ударам по позициям противника на подступах к Либаве, Риге и Таллину.
За мужество и героизм, проявленные в боях с фашистской Германией, указами Президиума Верховного Совета СССР, приказами Верховного Главнокомандующего и Народного Комиссариата ВМФ отдельный части и соединения ВВС БФ получили звания «Гвардейские», были награждены орденами и удостоены почётных наименований.
Разведывательная авиация:
- 15-й отдельный разведывательный авиационный полк награждён орденами Ушакова и Красного Знамени, присвоено наименование «Таллинский».
Минно-торпедная и бомбардировочная авиация:
- 8-я минно-торпедная авиационная дивизия награждена орденом Красного Знамени, присвоено наименование «Гатчинская»;
- 1-й минно-торпедный авиационный полк преобразован в 1-й гвардейский МТАП, награждён орденом Красного Знамени. Присвоено почётное наименование «Клайпедский»;
- 51-й минно-торпедный авиационный полк награждён орденами Ушакова и Нахимова. Присвоено почётное наименование «Таллинский»;
- 73-й бомбардировочный авиационный полк преобразован в 12-й гвардейский пикировочно-бомбардировочный авиационный полк. Награждён орденами Ушакова и Красного Знамени и получил почётное наименование «Таллинский».
Истребительная авиация:
- 3-я истребительная авиационная дивизия (бывш. 61 -я ИАБ) преобразована в 1 -ю гвардейскую ИАД и награждена орденом Красного Знамени. Присвоено почётное наименование «Выборгская»;
- 5-й истребительный авиационный полк преобразован в 3-й гвардейский ИАП и награждён орденом Красного Знамени;
- 9-й истребительный авиационный полк награждён орденами Красного Знамени и Ушакова, а также удостоен почётного наименования «Клайпедский»;
- 13-й истребительный авиационный полк преобразован в 4-й гварейский ИАП и награждён орденом Ушакова;
- 71-й истребительный авиационный полк преобразован в 10-й гвардейский ИАП и награжден орденом Красного Знамени;
- 13-й истребительный Краснознамённый авиационный полк (П-го формирования) (бывший 13-я ОИАЭ) преобразован в 14-й гвардейский Краснознамённый ИАП. Полк награждён орденом Ушакова и ему присвоено почётное наименование «Клайпедский».
ВВС Северного флота за время войны совершили более 57 тысяч самолето-вылетов с налетом более 88 тысяч часов.
Потоплено и повреждено 178 различных кораблей и судов, уничтожено 1045 самлетов противника (933 – в воздушных боях).
За образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с фашисткими захватчиками и проявленное при этом мужество и героизм более 4 тысяч воинов-авиаторов награждены правительственными наградами. 53 летчика получили высокое звание Героя Советского Союза, а Б.Ф. Сафонов удостоен этого звания дважды.
Гвардейские соединения и части ВВС СФ:
- 2-й гвардейский Краснознаменный авиаполк (бывший 72-й авиационный Краснознаменный полк). Командир капитан И.К. Туманов. 15 июня 1942г. полку присвоено имя Б.Ф. Сафонова. В дальнейшем полк получил звание – 2-й гвардейский истребительный авиационный Печенгский Краснознаменный полк имени Б.Ф. Сафонова;
- 9-й гвардейский минно-торпедный авиаполк (бывший 24-й минно-торпедный авиаполк). Командир майор Ф.В. Костькин. В дальнешем назывался – 9-й гвардейский минно-торпедный авиационный Киркенесский Краснознаменный полк.
Краснознаменные авиационные соединения ВВС СФ:
- 72-й авиационный плк.Командир подполковник Г.П. Губанов;
- 9-й гвардейский минно-торпедный авиаполк. Командир подполковник Б.П. Сыромятников;
- 255-й истребительный авиационный авиаполк. Командир майор Н.Г. Чернов;
- 46-й штурмовой авиационный полк. Командир подполковник М.П. Михайлов;